تاکنون بیش از ششصد هزار جلد کتاب و نشریه ادواری در کلیۀ زمینههای تاریخ و فرهنگ اسلامی در کتابخانه این مرکز گرد آمده است و این کتابخانه را به بزرگ ترین کتابخانه تخصصی کشور تبدیل نموده است. و البته کتابخانه بزرگ دیجیتالی نیز با دهها هزار عنوان بصورت تمام متن از طریق شبکه اینترانت داخلی مرکز در اختیار مولفین قرار گرفته که به جز محققان این مرکز، دیگران نیز از آن استفاده میکنند. اتصال مرکز دائره المعارف بزرگ اسلامی به شبکههای رایانهای جهانی، ارتباط علمی استوارتری میان این مرکز و دیگر مؤسسات پژوهشی و کتابخانههای بزرگ جهان ایجاد کرده، و سبب غنای بیشتر این کتابخانه شده است.